ИЗУЧЕНИЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ЭСТРОГЕНСВЯЗЫВАЮЩИХ БЕЛКОВ АЛЬФА-ФЕТОПРОТЕИНА С 17Β-ЭСТРАДИОЛОМ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДА МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ
Способность с высокой аффинностью связывать как свободные, так и иммобилизованные эстрогены была продемонстрирована для АФП мыши и крысы. Для альфа-фетопротеина человека было показано высокоэффективное связывание иммобилизованных эстрогенов. Локализация эстрогенсвязывающего участка АФП крысы была произведена с использованием химерного белка и было показано, что он расположен в домене III и включает аминокислотные остатки (а.о.) 423-506. Предполагается, что пептидный фрагмент, состоящий из 15 а.о., ELIDLTGKMVSIAST (424-438), является высокоаффинным (с Кd около 10-8 М) эстрогенсвязывающим участком АФП крысы. Аналогичный участок был обнаружен в составе АФП мыши. Путем сравнения первичных структур АФП человека и крысы был выявлен участок ELMAITRKMAATAAT (а.о. 428-442), который, предположительно может также быть высокоаффинным эстрогенсвязывающим участком АФП человека. С использованием метода конкурентного анализа было показано, что пептидный фрагмент АФП человека AADIIIGHLCIRHEM (а.о. 458- 472) способен связывать 17β-эстрадиол со средней аффинностью (Кd около 10-5 М).
Целью нашего исследования являлось изучение эстрогенсвязывающей способности вышеуказанных пептидных фрагментов с использованием метода молекулярной динамики (МД). Для этого были созданы модельные системы, состоящие из молекул пептидов и 17β-эстрадиола в различных соотношениях (1:1, 1:4 и 4:1) с различным исходным расположением пептидов и гормона.. МД расчеты осуществляли при длине траектории 10 нс с использованием термостатов Берендсена и столкновительного с заданными температурами 300, 600 и 1000К. Обработку полученных траекторий осуществляли с помощью оригинальной программы для расчета парных расстояний и свободной энергии взаимодействия (∆F).
Была произведена оценка связывающей способности каждого пептида и аминокислотных остатков, предпочтительно участвующих во взаимодействии. Показпно, что в составе пептида ELMAITRKMAATAAT АФП человека во взаимодействии участвуют следующие а.о.: Glu-428, Leu-429, Ile-432, Arg-434, Met-436, Ala-440, Ala-441 и Thr-442. В составе низкоаффинного петида АФП человека предпочтительными являются а.о. Ala-458, Ala-459, Asp-460, Ile-461, Ile-462, His-465 и Arg-469. В составе пептидного фрагмента АФП крысы в образовании коплекса с гормоном участвуют Glu-424, Asp-427, Lys-432, Met-433, Ile-435, Ala-436 и Ser-437. Связывание гормона зависело также от изменения конформации пептидов, оцениваемому по двумерным и трехмерным картам распределения плотности вероятности для торсионных углов φ, ψ, χ .
Статья в формате PDF 132 KB...
23 04 2024 18:30:51
Данная статья посвящена актуальной проблеме – развитию селезенки как органа иммунной системы на этапах постнатального онтогенеза. Приведен сравнительный анализ литературных источников по постнатальному развитию селезенки. В работах отмечается разноречивость некоторых суждений исследователей, касающихся органогенеза и гистогенеза данного органа. ...
22 04 2024 11:41:33
Статья в формате PDF 117 KB...
20 04 2024 10:48:33
Предлагается метод измерения температуры, с целью уменьшения погрешности измерений и увеличения точности бесконтактного измерения. Существенной особенностью предлагаемого метода является возможность использования двухступенчатого подхода с предварительной или дополнительной регистрацией состояния системы и теплового излучения для уточнения измерения температуры. ...
19 04 2024 22:58:25
Статья в формате PDF 141 KB...
17 04 2024 14:23:23
Статья в формате PDF 127 KB...
16 04 2024 6:58:44
Статья в формате PDF 112 KB...
15 04 2024 5:13:40
Статья в формате PDF 121 KB...
14 04 2024 13:37:32
Статья в формате PDF 100 KB...
13 04 2024 7:40:39
Впервые было изучено интерлейкина – 8 – 251 ТА среди женщин Азербайджана больными эндометриозом. 50 пpaктически здоровых и 70 женщин больных эндомертиозом находились под нашем наблюдением. Исследование показали что, генетический полиморизм интерлейкина – 8 А/Т 251 играет роль в потогенезе эндометриоза. ...
12 04 2024 14:56:25
Статья в формате PDF 107 KB...
11 04 2024 5:28:57
Статья в формате PDF 145 KB...
10 04 2024 23:58:15
Статья в формате PDF 258 KB...
09 04 2024 18:39:46
Статья в формате PDF 110 KB...
08 04 2024 23:47:12
В работе на созданных молекулярно-генетических моделях выявлена ассоциация генотипа А2/А2 локуса TAG 1A гена рецептора дофамина второго типа крыс с повышенной аудиогенной чувствительностью и увеличением удельной площади базолатеральной группировки миндалевидного комплекса по сравнению с крысами А1/А1. ...
06 04 2024 4:44:15
В статье показано увеличение интереса граждан России к истории и культуре стран ислама. Это связано с повышением политической активности этих стран и расширением их туристического сервиза. ...
05 04 2024 5:27:31
Статья в формате PDF 121 KB...
04 04 2024 13:57:30
Статья в формате PDF 143 KB...
03 04 2024 6:33:39
В статье доктора искусствоведения профессора Саратовской консерватории, члeна-корреспондента Российской академии естествознания даётся обоснование нового научного направления – универсального искусствознания, целью которого является комплексное исследование художественного процесса с вовлечением всех видов искусства в их глобальном охвате, а также построение художественной картины мира как особого рода исторической памяти. ...
02 04 2024 17:11:31
Статья в формате PDF 129 KB...
31 03 2024 23:38:34
Статья в формате PDF 104 KB...
30 03 2024 3:12:28
Статья в формате PDF 213 KB...
29 03 2024 0:26:54
Статья в формате PDF 145 KB...
28 03 2024 4:29:34
Статья в формате PDF 637 KB...
27 03 2024 10:28:51
Статья в формате PDF 143 KB...
26 03 2024 4:11:22
Статья в формате PDF 285 KB...
25 03 2024 14:55:43
Статья в формате PDF 313 KB...
24 03 2024 5:25:46
Статья в формате PDF 346 KB...
23 03 2024 18:41:17
Статья в формате PDF 307 KB...
22 03 2024 11:40:19
Статья в формате PDF 161 KB...
21 03 2024 12:21:24
Статья в формате PDF 271 KB...
20 03 2024 12:10:53
Статья в формате PDF 109 KB...
19 03 2024 8:21:39
Статья в формате PDF 105 KB...
18 03 2024 15:19:11
Статья в формате PDF 111 KB...
17 03 2024 2:22:24
Статья в формате PDF 108 KB...
16 03 2024 10:11:56
Разработан новый морфометрический показатель площади контакта эпителия и стромы. Показатель использовался автором при многолетних исследованиях морфофункционального состояния щитовидной железы у женщин и в эксперименте. ...
15 03 2024 2:41:44
Еще:
Поддержать себя -1 :: Поддержать себя -2 :: Поддержать себя -3 :: Поддержать себя -4 :: Поддержать себя -5 :: Поддержать себя -6 :: Поддержать себя -7 :: Поддержать себя -8 :: Поддержать себя -9 :: Поддержать себя -10 :: Поддержать себя -11 :: Поддержать себя -12 :: Поддержать себя -13 :: Поддержать себя -14 :: Поддержать себя -15 :: Поддержать себя -16 :: Поддержать себя -17 :: Поддержать себя -18 :: Поддержать себя -19 :: Поддержать себя -20 :: Поддержать себя -21 :: Поддержать себя -22 :: Поддержать себя -23 :: Поддержать себя -24 :: Поддержать себя -25 :: Поддержать себя -26 :: Поддержать себя -27 :: Поддержать себя -28 :: Поддержать себя -29 :: Поддержать себя -30 :: Поддержать себя -31 :: Поддержать себя -32 :: Поддержать себя -33 :: Поддержать себя -34 :: Поддержать себя -35 :: Поддержать себя -36 :: Поддержать себя -37 :: Поддержать себя -38 ::