Компъютерный анализ генома Vibrio vulnificus для выявления потенциальных локусов вариабельных простых тандемных повторов

Недавно расшифрован геном другого представителя рода Vibrio V. vulnificus штамм CMCP6. Целью настоящей работы являлся компъютерный анализ генома V. vulnificus с целью поиска потенциальных локусов VNTR, которые, в случае их вариабельности, можно использовать для молекулярно-генетической идентификации различных штаммов возбудителя.
Полная нуклеотидная структура первой и второй хромосом V. vulnificus размерами 3 281 945 и 1 844 853 нуклеотидов находились в GenBank по электронным адресам AE016795 и AE016796. Для анализа использовали авторскую компъютерную программу "Repeat 1.0". При этом параметры минимального пограничного значения величины и кратности нуклеотидных повторов были установлены в режиме "четыре по четыре". Выявление возможных нуклеотидных замен в повторах, приводящих к формированию дегенеративных тандемных повторов в данном исследовании не проводили.
Результаты компъютерного анализа свидетельствовали о существовании в геноме V. vulnificus значительного числа потенциальных локусов простых тандемных повторов. Так, в составе первой хромосомы обнаружено свыше 30 участков ДНК, содержащих повторы. Размер повторяющейся последовательности составлял от 6 до 8 нуклеотидов, а число повторов варьировало от 5 до 27. В составе второй (меньшей) хромосомы выявлено семь повторов длиной от пяти до девяти нуклеотидов. При этом кратность повторов варьировала от 5 до 23.
В целом число локусов, содержащих простые тандемные повторы в геноме V. vulnificus, приблизительно на порядок превышает их количество в составе генома холерного вибриона (Водопьянов, 2001). Учитывая, что размеры полных геномов указанных вибрионов пpaктически одинаковы, обнаруженные различия могут отражать особенности биологии возбудителей. Полученные результаты можно рассматривать как первый этап создания молекулярно-генетической системы мультилокусного VNTR-типирования V. vulnificus. Дальнейшим этапом работы может быть конструирование специфических праймеров и анализ коллекции штаммов с целью выявления вариабельных локусов.
11 06 2026 12:50:53
10 06 2026 3:13:46
Статья в формате PDF
130 KB...
08 06 2026 11:53:13
Статья в формате PDF
110 KB...
07 06 2026 20:34:57
Статья в формате PDF
122 KB...
05 06 2026 0:48:18
Статья в формате PDF
140 KB...
04 06 2026 12:36:27
Статья в формате PDF
113 KB...
03 06 2026 4:32:44
Статья в формате PDF
111 KB...
02 06 2026 5:17:12
Статья в формате PDF
210 KB...
01 06 2026 9:48:52
Статья в формате PDF
157 KB...
31 05 2026 13:40:13
Статья в формате PDF
295 KB...
30 05 2026 23:42:22
Статья в формате PDF
103 KB...
29 05 2026 19:35:27
Статья в формате PDF
101 KB...
28 05 2026 20:18:42
В статье показано увеличение интереса граждан России к истории и культуре стран ислама. Это связано с повышением политической активности этих стран и расширением их туристического сервиза.
...
27 05 2026 4:27:17
Статья в формате PDF
119 KB...
26 05 2026 0:12:15
Статья в формате PDF
124 KB...
25 05 2026 5:46:26
Статья в формате PDF
108 KB...
24 05 2026 16:44:34
Статья в формате PDF
136 KB...
23 05 2026 23:26:46
22 05 2026 8:50:31
Статья в формате PDF
126 KB...
21 05 2026 3:11:43
Статья в формате PDF 110 KB...
20 05 2026 15:29:20
Статья в формате PDF 117 KB...
19 05 2026 19:49:53
Вовлечение серой лесной почвы в сельскохозяйственное производство в течение 26 лет приводит к формированию специфических свойств, которые обусловлены преобразованием микроагрегированности почв. Активность этого процесса зависит от типа агрогенной нагрузки. Так механическое воздействие на серую лесную почву в результате ежегодной отвальной вспашки на 20–22 см вызывает изменение коэффициента полидисперсности и фактора дисперсности в слое 30–40 см. Применение ежегодной безотвальной обработки на глубину 6–8 см не оказывает существенного влияние на микроагрегированность почвы, что не приводит к формированию плужной подошвы.
...
18 05 2026 22:17:54
Статья в формате PDF
127 KB...
17 05 2026 16:23:30
Статья в формате PDF
139 KB...
16 05 2026 1:18:19
В исследовании изучена возможность оптимизации терапии больных урогeнитaльным xлaмидиозом, на основе внедрения новой методики цитокининдуцированного определения чувствительности к лекарственным средствам. Под наблюдением находилось 240 больных урогeнитaльным xлaмидиозом обоего пола, в возрасте от 18 до 65 лет. В результате применения цитокининдуцированной методики определения чувствительности к лекарственным средствам, удалось значительным образом повысить эффективность терапии больных xлaмидиозом.
...
15 05 2026 19:36:37
Одной из наиболее актуальных проблем современности является проблема обеспечения населения качественной питьевой водой. Для решения проблемы деффицита воды Прикаспийского региона в 1989 году был построен водовод «Астpaxaнь-Мангышлак», общей протяженностью 1041 км который берет свое начало из протоки Кигач, расположенной в дельте р. Волга. Биотестирование на дафниях в исходной воде и в воде, трaнcпортируемой по водоводу показало, что процент погибших дафний по сравнению с контролем составляет в зимний период 14%, а в весенний – 20%. В летний период процент погибших дафний явлется наиболее выским – 31,8% и к осени этот показатель снижается до 23,8%. Эти значения меньше 50%, то есть в соответствии с п.3.1.5 РД – 118-02-90 тестируемая вода не оказывает острого токсического действия на дафний.
...
14 05 2026 17:24:10
Статья в формате PDF
257 KB...
13 05 2026 18:35:58
12 05 2026 23:23:55
Статья в формате PDF
113 KB...
11 05 2026 15:20:24
Статья в формате PDF
114 KB...
10 05 2026 6:11:30
Статья в формате PDF
109 KB...
09 05 2026 15:43:37
Статья в формате PDF
125 KB...
08 05 2026 16:56:55
Статья в формате PDF
115 KB...
07 05 2026 18:44:37
Статья в формате PDF
227 KB...
05 05 2026 15:14:18
04 05 2026 1:25:55
Статья в формате PDF
119 KB...
03 05 2026 12:26:53
Еще:
Поддержать себя -1 :: Поддержать себя -2 :: Поддержать себя -3 :: Поддержать себя -4 :: Поддержать себя -5 :: Поддержать себя -6 :: Поддержать себя -7 :: Поддержать себя -8 :: Поддержать себя -9 :: Поддержать себя -10 :: Поддержать себя -11 :: Поддержать себя -12 :: Поддержать себя -13 :: Поддержать себя -14 :: Поддержать себя -15 :: Поддержать себя -16 :: Поддержать себя -17 :: Поддержать себя -18 :: Поддержать себя -19 :: Поддержать себя -20 :: Поддержать себя -21 :: Поддержать себя -22 :: Поддержать себя -23 :: Поддержать себя -24 :: Поддержать себя -25 :: Поддержать себя -26 :: Поддержать себя -27 :: Поддержать себя -28 :: Поддержать себя -29 :: Поддержать себя -30 :: Поддержать себя -31 :: Поддержать себя -32 :: Поддержать себя -33 :: Поддержать себя -34 :: Поддержать себя -35 :: Поддержать себя -36 :: Поддержать себя -37 :: Поддержать себя -38 ::