Компъютерный анализ генома Vibrio vulnificus для выявления потенциальных локусов вариабельных простых тандемных повторов
Недавно расшифрован геном другого представителя рода Vibrio V. vulnificus штамм CMCP6. Целью настоящей работы являлся компъютерный анализ генома V. vulnificus с целью поиска потенциальных локусов VNTR, которые, в случае их вариабельности, можно использовать для молекулярно-генетической идентификации различных штаммов возбудителя.
Полная нуклеотидная структура первой и второй хромосом V. vulnificus размерами 3 281 945 и 1 844 853 нуклеотидов находились в GenBank по электронным адресам AE016795 и AE016796. Для анализа использовали авторскую компъютерную программу "Repeat 1.0". При этом параметры минимального пограничного значения величины и кратности нуклеотидных повторов были установлены в режиме "четыре по четыре". Выявление возможных нуклеотидных замен в повторах, приводящих к формированию дегенеративных тандемных повторов в данном исследовании не проводили.
Результаты компъютерного анализа свидетельствовали о существовании в геноме V. vulnificus значительного числа потенциальных локусов простых тандемных повторов. Так, в составе первой хромосомы обнаружено свыше 30 участков ДНК, содержащих повторы. Размер повторяющейся последовательности составлял от 6 до 8 нуклеотидов, а число повторов варьировало от 5 до 27. В составе второй (меньшей) хромосомы выявлено семь повторов длиной от пяти до девяти нуклеотидов. При этом кратность повторов варьировала от 5 до 23.
В целом число локусов, содержащих простые тандемные повторы в геноме V. vulnificus, приблизительно на порядок превышает их количество в составе генома холерного вибриона (Водопьянов, 2001). Учитывая, что размеры полных геномов указанных вибрионов пpaктически одинаковы, обнаруженные различия могут отражать особенности биологии возбудителей. Полученные результаты можно рассматривать как первый этап создания молекулярно-генетической системы мультилокусного VNTR-типирования V. vulnificus. Дальнейшим этапом работы может быть конструирование специфических праймеров и анализ коллекции штаммов с целью выявления вариабельных локусов.
Статья в формате PDF
98 KB...
21 07 2026 4:18:49
Статья в формате PDF
107 KB...
20 07 2026 4:54:46
Статья в формате PDF
115 KB...
19 07 2026 7:40:40
Статья в формате PDF
94 KB...
18 07 2026 8:53:19
Статья в формате PDF
103 KB...
17 07 2026 2:20:12
Статья в формате PDF
119 KB...
16 07 2026 15:55:44
Статья в формате PDF
103 KB...
15 07 2026 10:39:53
Статья в формате PDF
114 KB...
14 07 2026 3:57:30
Статья в формате PDF
301 KB...
13 07 2026 13:51:49
Статья в формате PDF
138 KB...
11 07 2026 8:26:39
Статья в формате PDF
112 KB...
09 07 2026 4:34:14
Статья в формате PDF
266 KB...
08 07 2026 2:27:41
Статья в формате PDF
115 KB...
06 07 2026 6:37:28
Статья в формате PDF
123 KB...
04 07 2026 15:11:33
Статья в формате PDF
96 KB...
03 07 2026 10:42:37
Статья в формате PDF
263 KB...
02 07 2026 12:28:40
Статья в формате PDF
290 KB...
30 06 2026 11:43:36
Статья в формате PDF
109 KB...
29 06 2026 20:25:37
Статья в формате PDF
559 KB...
28 06 2026 23:20:15
В работе приводятся сведения относительно возможности применения тестовых заданий и биологических задач для исследования личностных особенностей учащихся и выявления одаренных детей. Показано, что использование этого подхода может способствовать повышению эффективности выявления школьников с повышенным уровнем интеллекта.
...
27 06 2026 2:50:49
Статья в формате PDF
137 KB...
24 06 2026 6:13:19
Статья в формате PDF
118 KB...
23 06 2026 9:32:34
Статья в формате PDF
112 KB...
21 06 2026 20:46:14
Статья в формате PDF
275 KB...
20 06 2026 6:58:34
Статья в формате PDF
126 KB...
19 06 2026 21:30:32
Статья в формате PDF
264 KB...
18 06 2026 5:21:34
Статья в формате PDF
104 KB...
17 06 2026 1:30:55
Статья в формате PDF
116 KB...
16 06 2026 8:35:48
Статья в формате PDF
116 KB...
15 06 2026 1:26:25
Статья в формате PDF
113 KB...
14 06 2026 7:47:50
В настоящем обзоре проанализированы и обобщены современные данные о роли микро-РНК (miРНК) в тонкой подстройке циркадианных биологических часов (БЧ) на уровне центрального осциллятора (супрахиазматических ядер гипоталамуса, СХЯ) и в периферических тканях и органах. Обсуждаются механизмы воздействия miРНК (miR-132, miR-216, miR-182, miR-96, miR-122, miR-141, miR-192/94, miR-206) на этапы экспрессии ключевых генов БЧ. Продемонстрировано опосредованное этим влияние miРНК на параметры циркадианного ритма (период, амплитуда, фазовый ответ на внешний световой сигнал), а также участие данных процессов в модуляции физиологических ритмов на более высоких уровнях организации млекопитающих.
...
13 06 2026 4:59:26
Статья в формате PDF
103 KB...
12 06 2026 11:35:36
Еще:
Поддержать себя -1 :: Поддержать себя -2 :: Поддержать себя -3 :: Поддержать себя -4 :: Поддержать себя -5 :: Поддержать себя -6 :: Поддержать себя -7 :: Поддержать себя -8 :: Поддержать себя -9 :: Поддержать себя -10 :: Поддержать себя -11 :: Поддержать себя -12 :: Поддержать себя -13 :: Поддержать себя -14 :: Поддержать себя -15 :: Поддержать себя -16 :: Поддержать себя -17 :: Поддержать себя -18 :: Поддержать себя -19 :: Поддержать себя -20 :: Поддержать себя -21 :: Поддержать себя -22 :: Поддержать себя -23 :: Поддержать себя -24 :: Поддержать себя -25 :: Поддержать себя -26 :: Поддержать себя -27 :: Поддержать себя -28 :: Поддержать себя -29 :: Поддержать себя -30 :: Поддержать себя -31 :: Поддержать себя -32 :: Поддержать себя -33 :: Поддержать себя -34 :: Поддержать себя -35 :: Поддержать себя -36 :: Поддержать себя -37 :: Поддержать себя -38 ::
