АНАЛИЗ ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИХ ВЗАИМООТНОШЕНИЙ БЕЛКОВ СЕМЕЙСТВА АЛЬБУМИНОИДНЫХ ГЕНОВ
Методы: В настоящее время в базах данных первичных структур белков Swiss-Prot и TrEMBL существуют аминокислотные последовательности всех четырех представителей этого семейства лишь для трех биологических видов - человека, мыши и крысы. С использованием программы ClustalW (версия 1.82) нами осуществлено попарное выравнивание полных (незрелых) аминокислотных последовательностей альбумина, АФП, афамина и ВДСБ человека мыши и крысы. Степень сходства между белками оценивалась по значениям идентичности (score) в каждой паре.
Результаты: Значение идентичности для пары альбумин-АФП оказалось наибольшим у человека (40%) и наименьшим у крысы (32%), в то время как у мыши оно составляло 34%. В паре альбумин-афамин значения идентичности убывали в ряду человек (34%), мышь (29%) и крыса (28%). Значения идентичности в паре альбумин-ВДСБ оказались пpaктически одинаковыми у всех трех видов млекопитающих (22% у крысы и по 21% у человека и мыши).
В паре АФП-афамин наибольшая степень идентичности наблюдается у человека (39%), в то время как у мыши (32%) и крысы (31%) эти значения очень близки. Наименьшие значения идентичности оказалось хаpaктерно для пар АФП-ВДСБ (от19% у мыши до 17% у мыши и 16% у человека) и афамин-ВДСБ - у человека 19%, по 17% у мыши и крысы.
Выводы: Попарное выравнивание показало, что все четыре белка данного семейства обладают большим сходством у мыши и крысы, по сравнению с человеком. У всех рассмотренных биологических видов значения идентичности между парами убывают в ряду альбумин-АФП, АФП-афамин, альбумин-афамин, альбумин-ВДСБ, афамин-ВДСБ и АФП-ВДСБ. Причем, если значения идентичности между парами: альбумин-АФП, альбумин-афамин и АФП-афамин у разных видов отличаются на 5-8%, то степени идентичности между парами с участием ВДСБ отличаются лишь на 1-3%.
Сходство первичных последовательностей в парах альбумин-ВДСБ и АФП-ВДСБ у человека меньше, чем у грызунов, в то время как во всех остальных парах значения идентичности у человека заметно превышают эти значения у грызунов. Здесь, вероятно имеет место неравномерность дивергенции этих белков в процессе эволюции.
Наименьшая степень сходства в парах с ВДСБ объясняется тем обстоятельством, что аминокислотная последовательность этого белка существенно короче у всех видов (полная аминокислотная последовательность составляет 474 а.о. у человека и 476 а.о. у грызунов), чем в других белках (от 599- до 611 а.о. в незрелых белках). Попарное выравнивание выявляет большие участки выпадений аминокислотных остатков вблизи от или на С-конце полипептидной цепи. Вероятно, витамин Д-связывающий белок является самым молодым представителем семейства белков альбуминоидных генов и ген, кодирующий этот белок, образовался в процессе эволюции путем делеций или вырезания больших участков на 5´-конце (или вблизи от 5´-конца) гена-предшественника.
Статья в формате PDF 251 KB...
25 04 2024 14:57:37
Статья в формате PDF 106 KB...
24 04 2024 4:41:23
Статья в формате PDF 494 KB...
23 04 2024 18:43:17
Статья в формате PDF 243 KB...
21 04 2024 15:41:24
Статья в формате PDF 102 KB...
20 04 2024 21:50:27
Статья в формате PDF 102 KB...
19 04 2024 2:59:39
Статья в формате PDF 123 KB...
18 04 2024 12:33:50
Статья в формате PDF 115 KB...
17 04 2024 0:18:16
Статья в формате PDF 390 KB...
16 04 2024 23:50:33
Статья в формате PDF 183 KB...
15 04 2024 2:22:55
Статья в формате PDF 113 KB...
14 04 2024 17:54:34
Статья в формате PDF 314 KB...
13 04 2024 17:54:30
Статья в формате PDF 104 KB...
12 04 2024 23:38:43
10 04 2024 15:23:51
Статья в формате PDF 315 KB...
09 04 2024 10:44:14
Статья в формате PDF 116 KB...
08 04 2024 20:58:22
Статья в формате PDF 148 KB...
07 04 2024 1:45:26
Статья в формате PDF 115 KB...
06 04 2024 13:55:31
Статья в формате PDF 102 KB...
05 04 2024 14:32:39
Статья в формате PDF 121 KB...
04 04 2024 4:29:20
Статья в формате PDF 109 KB...
03 04 2024 14:50:45
Статья в формате PDF 208 KB...
02 04 2024 9:36:28
Статья в формате PDF 107 KB...
01 04 2024 9:57:25
Статья в формате PDF 126 KB...
31 03 2024 6:33:47
Статья в формате PDF 135 KB...
30 03 2024 0:27:14
Статья в формате PDF 120 KB...
29 03 2024 3:37:44
Статья в формате PDF 114 KB...
28 03 2024 19:39:13
Статья в формате PDF 138 KB...
27 03 2024 19:54:15
Статья в формате PDF 127 KB...
26 03 2024 7:36:15
Статья в формате PDF 227 KB...
25 03 2024 23:54:21
Статья в формате PDF 121 KB...
24 03 2024 6:20:34
Статья в формате PDF 113 KB...
23 03 2024 15:42:24
Статья в формате PDF 113 KB...
22 03 2024 22:20:37
Статья в формате PDF 106 KB...
21 03 2024 4:20:17
Статья в формате PDF 147 KB...
20 03 2024 6:49:58
Статья в формате PDF 112 KB...
19 03 2024 11:14:51
Статья в формате PDF 217 KB...
18 03 2024 22:47:25
Статья в формате PDF 114 KB...
17 03 2024 7:40:26
Еще:
Поддержать себя -1 :: Поддержать себя -2 :: Поддержать себя -3 :: Поддержать себя -4 :: Поддержать себя -5 :: Поддержать себя -6 :: Поддержать себя -7 :: Поддержать себя -8 :: Поддержать себя -9 :: Поддержать себя -10 :: Поддержать себя -11 :: Поддержать себя -12 :: Поддержать себя -13 :: Поддержать себя -14 :: Поддержать себя -15 :: Поддержать себя -16 :: Поддержать себя -17 :: Поддержать себя -18 :: Поддержать себя -19 :: Поддержать себя -20 :: Поддержать себя -21 :: Поддержать себя -22 :: Поддержать себя -23 :: Поддержать себя -24 :: Поддержать себя -25 :: Поддержать себя -26 :: Поддержать себя -27 :: Поддержать себя -28 :: Поддержать себя -29 :: Поддержать себя -30 :: Поддержать себя -31 :: Поддержать себя -32 :: Поддержать себя -33 :: Поддержать себя -34 :: Поддержать себя -35 :: Поддержать себя -36 :: Поддержать себя -37 :: Поддержать себя -38 ::