ИЗУЧЕНИЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ЭСТРОГЕНСВЯЗЫВАЮЩИХ БЕЛКОВ АЛЬФА-ФЕТОПРОТЕИНА С 17Β-ЭСТРАДИОЛОМ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДА МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ
Способность с высокой аффинностью связывать как свободные, так и иммобилизованные эстрогены была продемонстрирована для АФП мыши и крысы. Для альфа-фетопротеина человека было показано высокоэффективное связывание иммобилизованных эстрогенов. Локализация эстрогенсвязывающего участка АФП крысы была произведена с использованием химерного белка и было показано, что он расположен в домене III и включает аминокислотные остатки (а.о.) 423-506. Предполагается, что пептидный фрагмент, состоящий из 15 а.о., ELIDLTGKMVSIAST (424-438), является высокоаффинным (с Кd около 10-8 М) эстрогенсвязывающим участком АФП крысы. Аналогичный участок был обнаружен в составе АФП мыши. Путем сравнения первичных структур АФП человека и крысы был выявлен участок ELMAITRKMAATAAT (а.о. 428-442), который, предположительно может также быть высокоаффинным эстрогенсвязывающим участком АФП человека. С использованием метода конкурентного анализа было показано, что пептидный фрагмент АФП человека AADIIIGHLCIRHEM (а.о. 458- 472) способен связывать 17β-эстрадиол со средней аффинностью (Кd около 10-5 М).
Целью нашего исследования являлось изучение эстрогенсвязывающей способности вышеуказанных пептидных фрагментов с использованием метода молекулярной динамики (МД). Для этого были созданы модельные системы, состоящие из молекул пептидов и 17β-эстрадиола в различных соотношениях (1:1, 1:4 и 4:1) с различным исходным расположением пептидов и гормона.. МД расчеты осуществляли при длине траектории 10 нс с использованием термостатов Берендсена и столкновительного с заданными температурами 300, 600 и 1000К. Обработку полученных траекторий осуществляли с помощью оригинальной программы для расчета парных расстояний и свободной энергии взаимодействия (∆F).
Была произведена оценка связывающей способности каждого пептида и аминокислотных остатков, предпочтительно участвующих во взаимодействии. Показпно, что в составе пептида ELMAITRKMAATAAT АФП человека во взаимодействии участвуют следующие а.о.: Glu-428, Leu-429, Ile-432, Arg-434, Met-436, Ala-440, Ala-441 и Thr-442. В составе низкоаффинного петида АФП человека предпочтительными являются а.о. Ala-458, Ala-459, Asp-460, Ile-461, Ile-462, His-465 и Arg-469. В составе пептидного фрагмента АФП крысы в образовании коплекса с гормоном участвуют Glu-424, Asp-427, Lys-432, Met-433, Ile-435, Ala-436 и Ser-437. Связывание гормона зависело также от изменения конформации пептидов, оцениваемому по двумерным и трехмерным картам распределения плотности вероятности для торсионных углов φ, ψ, χ .
Статья в формате PDF
128 KB...
23 03 2026 12:40:35
Статья в формате PDF
89 KB...
22 03 2026 21:14:58
Статья в формате PDF
221 KB...
20 03 2026 10:15:43
Статья в формате PDF
217 KB...
19 03 2026 7:10:50
Статья в формате PDF
111 KB...
17 03 2026 21:20:17
Статья в формате PDF
149 KB...
15 03 2026 21:43:19
Костная ткань обладает целым рядом уникальных физических свойств. Наиболее ценными с производственной точки зрения, представляются только некоторые из них: жесткость, твердость, упругость, эластичность. Наш научный интерес проявился на два основных свойства: жесткость и эластичность.
...
14 03 2026 21:18:21
Статья в формате PDF
126 KB...
12 03 2026 8:49:26
Статья в формате PDF
98 KB...
11 03 2026 15:45:35
Статья в формате PDF
113 KB...
10 03 2026 17:40:41
Статья в формате PDF 178 KB...
09 03 2026 8:24:12
Статья в формате PDF
107 KB...
08 03 2026 12:21:21
Статья в формате PDF
329 KB...
07 03 2026 6:46:17
Статья в формате PDF
105 KB...
05 03 2026 17:48:31
Статья в формате PDF
350 KB...
04 03 2026 12:10:22
Статья в формате PDF
196 KB...
03 03 2026 14:44:21
Статья в формате PDF
139 KB...
01 03 2026 1:40:18
Статья в формате PDF
261 KB...
27 02 2026 8:10:23
Статья посвящена решению проблемы сварки металлов, имеющих на поверхности тугоплавкие окисные пленки. Были проведены исследования дугового разряда обратной полярности, горящий между соплом плазменной горелки и изделием, возбуждаемый и стабилизируемый с помощью факела плазмы, в ходе экспериментов были получены сваренные образцы из цветных металлов и алюминия.
...
26 02 2026 20:39:15
Статья в формате PDF
144 KB...
25 02 2026 10:54:10
Статья в формате PDF
120 KB...
24 02 2026 19:56:53
Статья в формате PDF
113 KB...
23 02 2026 11:18:59
Статья в формате PDF
321 KB...
22 02 2026 22:22:40
Статья в формате PDF
116 KB...
21 02 2026 20:30:18
Статья в формате PDF
105 KB...
20 02 2026 7:29:14
Статья в формате PDF
332 KB...
19 02 2026 4:36:52
Статья в формате PDF
115 KB...
18 02 2026 11:38:37
Статья в формате PDF
266 KB...
17 02 2026 16:10:36
Статья в формате PDF
200 KB...
15 02 2026 19:39:39
Статья в формате PDF
254 KB...
14 02 2026 7:18:40
Статья в формате PDF
257 KB...
13 02 2026 11:12:38
Статья в формате PDF
273 KB...
12 02 2026 13:39:12
Еще:
Поддержать себя -1 :: Поддержать себя -2 :: Поддержать себя -3 :: Поддержать себя -4 :: Поддержать себя -5 :: Поддержать себя -6 :: Поддержать себя -7 :: Поддержать себя -8 :: Поддержать себя -9 :: Поддержать себя -10 :: Поддержать себя -11 :: Поддержать себя -12 :: Поддержать себя -13 :: Поддержать себя -14 :: Поддержать себя -15 :: Поддержать себя -16 :: Поддержать себя -17 :: Поддержать себя -18 :: Поддержать себя -19 :: Поддержать себя -20 :: Поддержать себя -21 :: Поддержать себя -22 :: Поддержать себя -23 :: Поддержать себя -24 :: Поддержать себя -25 :: Поддержать себя -26 :: Поддержать себя -27 :: Поддержать себя -28 :: Поддержать себя -29 :: Поддержать себя -30 :: Поддержать себя -31 :: Поддержать себя -32 :: Поддержать себя -33 :: Поддержать себя -34 :: Поддержать себя -35 :: Поддержать себя -36 :: Поддержать себя -37 :: Поддержать себя -38 ::
