АНАЛОГОВОЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЕ ЭЛЕМЕНТАРНЫХ ЗВЕНЬЕВ ДНК
Четыре органические молекулы (нуклеотиды) - аденин (А), гуанин (G), цитозин (C) и тимин/урацил (T/U) являются алфавитом, с помощью которого осуществляется кодирование всей генетической информации. Известно, что генетический код избыточен, при этом, 61 триплет кодирует только 20 аминокислот (еще 3 триплета являются старт- и стоп-кодонами: Ochre, Amber, Opal).
Формальное представление AGTC-элементов и связей между двумя элементами комплементарного и последовательного хаpaктера ранжируется с учётом некоторых критериев. В связи с тем, что модель биологической структуры должна наиболее достоверно отражать её информационную сущность, желательно, чтобы критерий был не один, а физическая природа критериев не должна быть одинаковой. Ниже в качестве таковых используются особенности физического хаpaктера.
Все 64 триплета представлены в виде массивов VF[3,1], элементами которых являются весовые эквиваленты сочетаний нуклеотидов вида X1X2 , которые зависят от таких физических параметров, как молекулярная масса и сила водородных связей между комплементарными нуклеотидами. Альтернативным путем является представление каждого нуклеотида в виде символов четырехзначного счисления, упорядоченных по убыванию их молекулярной массы.
Представив последовательность трех значений массивов в виде кривой, можно описать ее с помощью некоторой функции Fx1x2x3, где х1х2х3 - последовательность нуклеотидов в триплете, i=1..3.
Функции триплетов были получены в программе MathCAD 9. В данной программе реализована возможность выполнения линейной регрессии общего вида. При ней заданная совокупность точек приближается функцией вида F(x,К1,К2,.., Kn)= K1F1(x)+K2F2(x)+...+КnFn(x). Таким образом, функция регрессии является линейной комбинацией функций F1(x),F2(x),..,Fn(x), причем сами эти функции могут быть нелинейными, что резко расширяет возможности такой аппроксимации и распространяет ее на нелинейные функции. Для реализации линейной регрессии общего вида используется функция linfit(VX,VY,F). Эта функция возвращает массив коэффициентов линейной регрессии общего вида К, при котором среднеквадратичная погрешность приближения облака исходных точек, если их координаты хранятся в векторах VX и VY, оказывается минимальной. Массив F должен содержать базисные функции F1(x), F2(x), , Fn(x), записанные в символьном виде, причем количество элементов массива F должно быть меньше чем количество элементов массивов VX и VY .
Для оценки точности аппроксимации использована нуклеотидная последовательность длиной 150 нуклеотидов или 50 триплетов 5´-концевого сегмента 16S-pPHK E.coli. Подсчитано, что точность аппроксимации составила 5,3%.
Применение числовых эквивалентов позволило представить маски аминокислот в виде функций с небольшой погрешностью. Это создает предпосылки для дальнейшего укрупнения элементарных нуклеотидных последовательностей, и формирования базы данных образов по их функциональной принадлежности.
Статья в формате PDF
108 KB...
11 06 2026 11:17:54
Статья в формате PDF
109 KB...
10 06 2026 17:43:23
Статья в формате PDF
110 KB...
08 06 2026 19:42:21
Статья в формате PDF
105 KB...
07 06 2026 15:34:42
Статья в формате PDF
86 KB...
06 06 2026 20:28:56
Статья в формате PDF
107 KB...
04 06 2026 22:44:38
Статья в формате PDF
485 KB...
01 06 2026 21:24:28
Статья в формате PDF
118 KB...
31 05 2026 13:22:37
Статья в формате PDF
120 KB...
30 05 2026 19:49:17
Статья в формате PDF
104 KB...
29 05 2026 10:30:39
Статья в формате PDF
136 KB...
28 05 2026 11:28:14
Статья в формате PDF
101 KB...
27 05 2026 23:50:28
Статья в формате PDF
128 KB...
26 05 2026 22:10:44
Статья в формате PDF
135 KB...
25 05 2026 16:13:25
Статья в формате PDF
182 KB...
24 05 2026 19:33:32
Статья в формате PDF
106 KB...
23 05 2026 0:26:38
Статья в формате PDF
229 KB...
22 05 2026 20:40:34
Статья в формате PDF
284 KB...
20 05 2026 6:49:38
Статья в формате PDF
263 KB...
19 05 2026 16:42:35
Статья в формате PDF
115 KB...
18 05 2026 6:16:42
Статья в формате PDF
151 KB...
17 05 2026 20:59:40
Статья в формате PDF
126 KB...
16 05 2026 22:35:55
Статья в формате PDF
149 KB...
15 05 2026 21:56:43
В статье рассмотрен прцесс химического никелирования деталей машин и оборудования как эффетивный и экономически выгодный способ получения стойких покрытий. Предлагается внедрить этот процесс в технологию восстановления деталей автотpaкторной техники из алюминиевых сплавов.
...
14 05 2026 3:25:34
Статья в формате PDF
119 KB...
13 05 2026 6:21:44
Статья в формате PDF
90 KB...
12 05 2026 22:53:10
Статья в формате PDF
123 KB...
11 05 2026 21:46:54
Статья в формате PDF
98 KB...
10 05 2026 23:17:55
Статья в формате PDF
110 KB...
09 05 2026 0:30:32
Статья в формате PDF
350 KB...
08 05 2026 11:40:43
Статья в формате PDF
115 KB...
07 05 2026 7:44:23
Статья в формате PDF
415 KB...
06 05 2026 8:28:53
Статья в формате PDF
105 KB...
04 05 2026 7:19:51
Статья в формате PDF
122 KB...
03 05 2026 3:10:21
Еще:
Поддержать себя -1 :: Поддержать себя -2 :: Поддержать себя -3 :: Поддержать себя -4 :: Поддержать себя -5 :: Поддержать себя -6 :: Поддержать себя -7 :: Поддержать себя -8 :: Поддержать себя -9 :: Поддержать себя -10 :: Поддержать себя -11 :: Поддержать себя -12 :: Поддержать себя -13 :: Поддержать себя -14 :: Поддержать себя -15 :: Поддержать себя -16 :: Поддержать себя -17 :: Поддержать себя -18 :: Поддержать себя -19 :: Поддержать себя -20 :: Поддержать себя -21 :: Поддержать себя -22 :: Поддержать себя -23 :: Поддержать себя -24 :: Поддержать себя -25 :: Поддержать себя -26 :: Поддержать себя -27 :: Поддержать себя -28 :: Поддержать себя -29 :: Поддержать себя -30 :: Поддержать себя -31 :: Поддержать себя -32 :: Поддержать себя -33 :: Поддержать себя -34 :: Поддержать себя -35 :: Поддержать себя -36 :: Поддержать себя -37 :: Поддержать себя -38 ::
