АНАЛОГОВОЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЕ ЭЛЕМЕНТАРНЫХ ЗВЕНЬЕВ ДНК

Авторы
Файлы

Тверетин А.А. Подолян В.М. Статья в формате PDF 101 KB

Четыре органические молекулы (нуклеотиды) - аденин (А), гуанин (G), цитозин (C) и тимин/урацил (T/U) являются алфавитом, с помощью которого осуществляется кодирование всей генетической информации. Известно, что генетический код избыточен, при этом, 61 триплет кодирует только 20 аминокислот (еще 3 триплета являются старт- и стоп-кодонами: Ochre, Amber, Opal).

Формальное представление AGTC-элементов и связей между двумя элементами комплементарного и последовательного хаpaктера ранжируется с учётом некоторых критериев. В связи с тем, что модель биологической структуры должна наиболее достоверно отражать её информационную сущность, желательно, чтобы критерий был не один, а физическая природа критериев не должна быть одинаковой. Ниже в качестве таковых используются особенности физического хаpaктера.

Все 64 триплета представлены в виде массивов VF[3,1], элементами которых являются весовые эквиваленты сочетаний нуклеотидов вида X₁X₂, которые зависят от таких физических параметров, как молекулярная масса и сила водородных связей между комплементарными нуклеотидами. Альтернативным путем является представление каждого нуклеотида в виде символов четырехзначного счисления, упорядоченных по убыванию их молекулярной массы.

Представив последовательность трех значений массивов в виде кривой, можно описать ее с помощью некоторой функции Fx1x2x3, где х1х2х3 - последовательность нуклеотидов в триплете, i=1..3.

Функции триплетов были получены в программе MathCAD 9. В данной программе реализована возможность выполнения линейной регрессии общего вида. При ней заданная совокупность точек приближается функцией вида F(x,К1,К2,.., Kn)= K1F1(x)+K2F2(x)+...+КnFn(x). Таким образом, функция регрессии является линейной комбинацией функций F1(x),F2(x),..,Fn(x), причем сами эти функции могут быть нелинейными, что резко расширяет возможности такой аппроксимации и распространяет ее на нелинейные функции. Для реализации линейной регрессии общего вида используется функция linfit(VX,VY,F). Эта функция возвращает массив коэффициентов линейной регрессии общего вида К, при котором среднеквадратичная погрешность приближения облака исходных точек, если их координаты хранятся в векторах VX и VY, оказывается минимальной. Массив F должен содержать базисные функции F1(x), F2(x), , Fn(x), записанные в символьном виде, причем количество элементов массива F должно быть меньше чем количество элементов массивов VX и VY .

Для оценки точности аппроксимации использована нуклеотидная последовательность длиной 150 нуклеотидов или 50 триплетов 5´-концевого сегмента 16S-pPHK E.coli. Подсчитано, что точность аппроксимации составила 5,3%.

Применение числовых эквивалентов позволило представить маски аминокислот в виде функций с небольшой погрешностью. Это создает предпосылки для дальнейшего укрупнения элементарных нуклеотидных последовательностей, и формирования базы данных образов по их функциональной принадлежности.

О РОЛИ ЭКОНОМИЧЕСКИХ МЕХАНИЗМОВ В УПРАВЛЕНИИ ТЕХНОГЕННОЙ БЕЗОПАСНОСТЬЮ ПРЕДПРИЯТИЙ

Статья в формате PDF 151 KB...

11 08 2026 15:29:56

СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МАРШРУТОВ ТРАНСПОРТИРОВКИ УДОБРЕНИЙ СО СТАНЦИИ КЕМЕРОВО В ПОРТ ЧЕННАЙ

Статья в формате PDF 254 KB...

10 08 2026 20:15:50

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ЦИКЛА ДЕМИНГА И ПРОЦЕССНОГО ПОДХОДА ДЛЯ ПОВЫШЕНИЯ КАЧЕСТВА ВЫПУСКАЕМОЙ ПРОДУКЦИИ

Статья в формате PDF 124 KB...

09 08 2026 15:24:39

ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ ФИЛОСОФИИ И СОВРЕМЕННАЯ НАУКА (КАЗАНСКАЯ ШКОЛА ФИЛОСОФОВ: РУБЕЖ XX-XXI СТОЛЕТИЙ)

Статья в формате PDF 321 KB...

08 08 2026 18:29:23

ГОМЕОСТАЗ КАК ЕДИНСТВО МЕТАБОЛИЧЕСКОЙ, ИФОРМАЦИОННО-ИНТЕГРАТИВНОЙ И ЛОКОМОТОРНОЙ СИСТЕМ

Статья в формате PDF 132 KB...

07 08 2026 22:14:33

Параллельный алгоритм Соллина поиска остовного дерева

Статья в формате PDF 160 KB...

06 08 2026 20:43:46

ВИКТОР МИХАЙЛОВИЧ ПРОВОРОВ

Статья в формате PDF 87 KB...

05 08 2026 3:20:55

ХАРАКТЕРИСТИКА ФАГОЦИТОЗА И АПОПТОЗ НЕЙТРОФИЛЛОВ ПРИ АЛЛЕРГИЧЕСКОМ ВОСПАЛЕНИИ

Статья в формате PDF 120 KB...

04 08 2026 20:30:51

БЕСПЯТОВ ГЕННАДИЙ АЛЕКСАНДРОВИЧ

Статья в формате PDF 208 KB...

03 08 2026 15:30:56

СОДЕРЖАНИЕ ПОДГОТОВКИ ТОВАРОВЕДОВ-ЭКСПЕРТОВ В ОБЛАСТИ ИНФОКОММУНИКАЦИОННЫХ ТЕХНОЛОГИЙ

Статья в формате PDF 109 KB...

02 08 2026 10:34:39

СТОЛЯРОВ ВЛАДИМИР АЛЕКСЕЕВИЧ

Статья в формате PDF 139 KB...

01 08 2026 1:23:19

ПОКАЗАТЕЛИ МОЛЕКУЛ СРЕДНЕЙ МАССЫ У БОЛЬНЫХ ГРИППОМ С СОПУТСТВУЮЩИМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ

Статья в формате PDF 102 KB...

31 07 2026 9:52:59

ПЕРВИЧНО-МНОЖЕСТВЕННЫЙ СИНХРОННЫЙ РАК КОЖИ У МУЖЧИН

Представлено описание клинического наблюдения больного 68 лет, с первично-множественным paком кожи, у которого диагностировано 288 опухолевых очагов, 67 из которых пролечено различними методами, такими как кототкодистанционная рентгенотерапия, хирургическое иссечение, криодеструкция. ...

30 07 2026 16:52:43

БЕЗАВТОКЛАВНЫЕ СИЛИКАТНЫЕ ИЗДЕЛИЯ НА ОСНОВЕ МЕСТНЫХ СЫРЬЕВЫХ РЕСУРСОВ И ПРИРОДНЫХ ОТХОДОВ

Статья в формате PDF 121 KB...

29 07 2026 5:40:26

НЕЙРОПРОТЕКТОРНЫЙ ЭФФЕКТ ЦИКЛОПЕНТИЛАДЕНОЗИНА И ЛИДОКАИНА ПРИ ПОЛНОЙ ИШЕМИИ ГОЛОВНОГО МОЗГА В ЭКСПЕРИМЕНТЕ

Статья в формате PDF 305 KB...

28 07 2026 0:45:55

ОСОБЕННОСТИ КРОВООБРАЩЕНИЯ ПОЧЕК ПРИ ЭКСПЕРТИЗЕ РАССТРОЙСТВ МОЧЕИСПУСКАНИЯ У ПРИЗЫВНИКОВ УЛЬЯНОВСКОЙ ОБЛАСТИ

Статья в формате PDF 120 KB...

27 07 2026 22:24:51

Эколого-географическое районирование бассейна реки Кубань

Статья в формате PDF 304 KB...

26 07 2026 2:30:48

НЕКОНТАКТНОЕ ДЕЙСТВИЕ АНТРАЦЕНА НА ПРОРАСТАНИЕ СЕМЯН ПШЕНИЦЫ ПОД ВЛИЯНИЕМ ЭКЗОГЕННОГО АУКСИНА

Статья в формате PDF 112 KB...

25 07 2026 13:15:19

НАРУШЕНИЯ АЗОТИСТОГО И БЕЛКОВОГО ОБМЕНА КРЫС ПРИ ХРОНИЧЕСКОМ ВОЗДЕЙСТВИИ СЕЛЕНИТА НАТРИЯ

Статья в формате PDF 109 KB...

24 07 2026 10:40:19

ИНФОРМАЦИОННЫЕ УГРОЗЫ ЭКСТРЕМИЗМА В ОТНОШЕНИИ ДЕТЕЙ И МОЛОДЕЖИ

Статья в формате PDF 314 KB...

23 07 2026 12:14:46

СРАВНИТЕЛЬНАЯ ОЦЕНКА ВЛИЯНИЯ РАДИАЦИИ, ГИПОТИРЕОЗА И РТУТНОЙ ИНТОКСИКАЦИИ НА АКТИВНОСТЬ ФЕРМЕНТОВ ОБМЕНА ПУРИНОВЫХ НУКЛЕОТИДОВ, АНТИОКСИДАНТНОЙ СИСТЕМЫ И ИММУННЫЙ СТАТУС

В эксперименте в сравнительном плане, изучено влияние радиационного облучения, ртутной интоксикации и гипотиреоза на систему иммунитета, на активность ферментов обмена пуриновых нуклеотидов: 5’-нуклеотидазы, АМФ-дезаминазы и аденозиндезаминазы, на активность ферментов антиоксидантной системы: супероксиддисмутазы (СОД), глутатионпероксидазы (ГПО), глутатионредуктазы в ткани печени, почек и в сыворотке крови. Установлены значительные сходства в механизме клеточных и метаболических эффектов радиации, гипотиреоза, ртутной интоксикации. Независимо от ткани и воздействующего на организм фактора (радиация, гипотиреоз, ртутная интоксикация) имеет место однотипные изменения активности супероксиддисмутазы, глутатионпероксидазы и глутатионредуктазы, что свидетельствует о том, что указанные воздействия являются стрессорными. Изменения в иммунной системе, обнаруженные при ионизирующем излучении, пpaктически однотипны изменениям иммунитета при гипотиреозе. При ртутной интоксикации в отличие от гипотиреоза и радиации имеет место снижение уровня В-лимфоцитов, что в какой-то мере объясняется особенностями эффектов ртутной интоксикации на систему иммунитета и ферменты метаболизма пуриновых нуклеотидов. В определенной степени эти различия можно объяснить разной степенью становления защитных механизмов и степенью целостности регуляторной функции адрено-тиреоидной системы. ...