ЧАСТОТЫ ГАПЛОТИПОВ HLA DQB-DR (HF) НЕРАВНОВЕСНОЕ СЦЕПЛЕНИЕ (LD) В ОСНОВНЫХ ПОПУЛЯЦИЯХ ПРОЖИВАЮЩИХ В ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ

1

• Авторы
• Файлы

Суслова Т.А. Статья в формате PDF 304 KB Челябинская область расположена на Южном Урале. Данная территория, находясь на границе Европы и Азии, являлась местом пересечения многих трaнcпортных путей с Севера, Юга, Казахстана, Средней Азии, Сибири. Южный Урал находится на пересечении нескольких континентальных областей, где население хаpaктеризуется различными языками, религиями и культурой. Территория заселялась в результате смешения различных популяций: русских, башкир и татар. Русская этническая группа, проживающая на данной территории, относится к кавказоидам, В этногенезе башкир в различной степени участвовали иранские, финно-угорские и тюркские племена на протяжении двух последних тысячелетий. Основная цель работы - установление генетического профиля популяций русских и башкир, основанной на типировании HLA-A, -B -DRB1, DQA1 и DQB1 локусов.

Выбор HLA, как генетической системы для исследования обусловлен ещё и тем, что известно достаточно много ассоциаций некоторых генов HLA с заболеваниями. Наиболее классический пример HLA-ассоциированных заболеваний - связь HLA-DR4 аллели с ревматоидным артритом и HLA-B27 со спондилитом. Исследования наиболее важных ассоциаций между HLA и аутоиммунными заболеваниями, а также инфекциями публиковались ранее.В настоящей работе была оценена частота аллелей и гаплотипов HLA в двух южноуральских популяциях и их связанность с другими европейскими и монголоидными популяциями. Установление иммуногенетических норм распределения генов HLA в основных популяциях, проживающих в Челябинской области может явиться основой для проведения исследований о влиянии антропогенных факторов окружающей среды на здоровье населения. Материалы и методы. Типирование HLA 1 класса было проведено серологически, HLA 2 класса методом PCA-SSP.110 здоровых неродственных русских и 78 башкир, проживающих в Челябинской области, были протипированы по HLA-A, -B, DRB1, -DQA1, -DQB1 генам. Все они были русскими и башкирами и их семьи проживали в Челябинской области по меньшей мере на протяжении трех поколений. Все они были донорами крови.

Статистический анализ.

Частоты антигенов HLA были расчитаны по формуле AF - сумма частот аллели/ число обследованных лиц. LD - неравновесное сцепление двух локусов HLA определено как разность между ожидаемой и наблюдаемой частотой гаплотипа HLA. Достоверность различий оценивалась критерием Х^2.

Таблица 1. Частоты антигенов HLA в популяциях русских и башкир Челябинской области.

HLA	Русские	Башкиры	χ2	HLA	Русские	Башкиры	χ2
	Ах, %	Ах, %			Ах, %	Ах, %
А1	21,2	11,5	4,3	DR16	10.9	12	0
А2	53,7	66,7	5,1	DR17	19.1	6	5,6
А3	23,8	12,8	5	DR4	14.5	16	0
А9	23,3	24,4	0	DR11	19.1	8	4,1
А10	21,5	21,8	0	DR12	5.5	24	9,1
А11	13,5	12,8	0	DR13	26.4	30	0
А19	2,5	9,0	11,7	DR14	2.7	4	0,1
А28	1,1	2,6	1,3	DR7	23.6	38	1,6
А30	*	5,1	*	DR8	6.4	8	0
				DR9	5.5	10	0,6
В5	12,0	20,5	5	DR10	1.8	6	1,5
В7	23,5	20,5	0,4	DQA101	28,2	28	0,2
В8	13,0	6,4	2,9	DQA102	35,5	34	0,5
В12	16,2	9	2,9	DQA103	16,4	28	1,5
В13	12,4	32,1	25,4	DQA201	24,5	38	1,3
В14	6,4	2,6	1,9	DQA301	20,9	22	0,1
В15	13,0	9	1,1	DQA401	5,5	4	0,3
В16	10,5	9	0,2	DQA501	47,3	30	5,9
В17	7,5	7,7	0	DQA601	*	8	*
В18	11,8	9	0,6	DQB201	33,6	38	0
В21	3,8	6,4	1,3	DQB301	39,1	44	0
В22	2,3	2,6	0	DQB302	9,1	6	0,8
В27	12,5	12,8	0	DQB303	10,0	8	0,4
В35	20,1	10,3	4,6	DQB401/2	6,4	4	0,6
В40	13,2	23,1	6,3	DQB501	27,3	24	0,7
В41	6,6	2,6	2	DQB502/4	10,9	14	0,1
DR1	26.4	16	3,1	DQB601	3,6	4	0
DR15	26.4	16	3,1	DQB602/8	38,2	46	0,1

В таблице 1 представлены частоты антигенов HLA -A, -B, DRB1, DQA1 DQB1 в популяциях русских и башкир Челябинской области. Всего было определено 9 антигенов HLA-A, 16 HLA-B, 13 HLA-DRB1, 7 HLA-DQA и 9 HLA-DQB1.

Данные таблицы свидетельствуют о том, что наибольшие отличия по распределению антигенов HLA между двумя исследуемыми группами наблюдался в 1 классе (локусы А, где отмечены достоверные отличия по 4 антигенам, и В - также по 4 антигенам), и менее выражены в локусах 2 класса, Dr - 3 антигена, DqA - только 1 антиген. В локусе DqB вообще нет отличий в частоте встречаемости антигенов HLA между русской и башкирской этнических группах, проживающих на Южном Урале. Однако, величины Д неравновесного сцепления между генами HLA DqB и Dr имеют различные особенности у русского и башкирского населения, что приводит, по-видимому, и к различной частоте встречаемости этих антигенов в изучаемых популяциях.

Таблица 2. Неравновесное сцепление и частоты гаплотипов в популяциях русских и башкир, проживающих в Челябинской области.

Русские			Башкиры
Haplotype	LD	HF	Haplotype	LD	HF
DQB 201-Dr17	87.26	10.92	DQB 201-DR07	141.58	18.68
Dr 17 - В8	84,02	9,48	Dr 07 - В13	118.41	16.09
В8-А1	39.96	4,84	В13-А2	42,96	11,72
DqB 301 -Dr 11	83,08	10,56	DqB 301 - Dr 12	95,95	12,82
DqB 301 - Dr 04	20,0	3.0	DqB 301 - Dr 04	32,1	5,6
DqB 302 - Dr 4	35.4	3,9	DqB 302 - Dr 4	18.2	1.9
DqB 501 - Dr 1	108,6	12,7	DqB 501 - Dr 1	11,8	1,7
DqB 602/8 - Dr 13	102,2	13,6	DqB 602/8 - Dr 13	120	16,3
DqB 602/8 - Dr 15	81	11,0	DqB 602/8 - Dr 15	61	8,3

Итак, наименьшие различия в изученных популяциях отмечено по частоте встречаемости антигенов HLA DqB. Видимо этот локус является филогенетически наиболее древним и в момент формирования этого локуса исследуемые популяции составляли единую этническую общность или представляли из себя их общего предка. 4 основных антигена DqB встречаются с максимальной частотой и среди русских и среди башкир, проживающих на Южном Урале.. Это аллельные варианты DqB : 0201, 0301, 0501, 0602/8. Частота встречаемости каждого из них в обеих изучаемых популяциях составляет не менее 26%.

Наибольшее внимание привлекает аллель 0201. Он встречается у 38% башкир и 33,% русских. Однако неравновесное сцепление данного антигена с аллелями других локусов у данных популяций оказались различными. У русских DqB 0201 максимально сцеплен с DqA 501(78) и Dr 17 (87.26). Аллель Dr 17 в свою очередь имеет наибольшее сцепление с антигенами 1 класса В8 и А1, формируя, таким образом, устойчивый (древний) гаплотип А1-В8- DR-17-DqA 0501-DqB 0201. Лица, несущие в фенотипе этот гаплотип, отличаются сильными иммунологическими реакциями: выработка антител к чужеродным антигенам быстрая, их титр высокий и держится довольно долго. У них же очень часто повышены реакции гумopaльного и клеточного иммунитета на собственные антигены - что предрасполагает их носителей (в европейских популяциях) к развитию аутоиммунной патологии.

У башкир данный ген DqB 0201 имеет максимальное сцепление с DqA (Д=167) и DR 7 (Д=141), и с антигенами 1 класса В13-А2, формируя в популяции иной устойчивый «древний» гаплотип Dr 7-DQA 201- DQB 201. Возможно, лица, обладающие этим гаплотипом, имели селективное преимущество перед другими гаплотипами, этот признак закрепился в популяции в процессе естественного отбора. Он отмечен как доминирующий в некоторых других монголоидных популяциях: китайцы Хан, монголы, зороастрийцы Ирана, жители Тувы и некоторые другие популяции, проживающие на территории России - буряты, ханты-манси.

Именно различными генетическими сцеплениями локусов HLA DqB с Dr, а того, в свою очередь с В и А можно объяснить достоверное повышение частот встречаемости в популяции русских антигенов Dr 17, В8, и А1, по сравнению с башкирами, а у башкир достоверное повышение частот Dr 7, В13, А2.

Аллельный вариант DqB 301 также является наиболее распространённым в обеих изучаемых популяциях. Однако, в изучаемых нами популяциях Челябинской области отмечены различные гаметные ассоциации с этим антигеном. У русских этот аллельный вариант DqB 301 сцеплен с геном Dr 11 (Д=80,3 Н=10,6), у башкир вариант DqB 301 сцеплен с иной аллельной формой Dr 6, а именно Dr 12 (Д=95, Н=12,8), Такое генетическое сцепление и делает антигены локуса Dr наиболее распространёнными в популяциях. Dr 11 - среди русских, а Dr 12 среди башкир, проживающих в Челябинской области, именно по частоте встречаемости этих антигенов достоверно различаются две основные популяции, проживающие на Южном Урале. Генетические сцепления Dr с генами HLA 1 класса менее устойчивые в силу большего расстояния на хромосоме, и кроме того сам локус В более полиморфен, поэтому здесь труднее выявить какие-либо закономерности в генетиеских сцеплениях между локусами. Но однако, можно отметить всё же, что заметные сцепления (после А1-В8 Dr 17 у русских), и Dr 7-В13-А2) у башкир отмечается для пар антигенов Dr 12- В40 у башкир. Именно по этому антигену тоже есть разница в частоте встречаемости у русских и башкир.

Кроме того, в обеих популяциях с аллелем DqB 301 сцеплен вариант Dr 04, благодаря чему у этого антигена примерно равная частота встречаемости и у русских и у башкир. Что, возможно, должно приводить к равной частоте Dr 4-зависимых заболеваний в популяциях.

Если говорить о генетических сцеплениях антигена Dr 4 - то можно ещё отметить, что в популяции башкир ЮУ не отмечается закономерность, прослеживающаяся у других монголоидных популяции России: а именно - высокое сцепление с DqB 0302, приводящее к более выраженному частоте встречаемости Dr 4 в популяции. Это закономерность выявлена для чукчи, саами, амерингос и др изолятах, имеющие в своём этногенезе монголоидный компонент.

Третья наиболее распространённая аллель локуса DqB - DqB 501 имеет одинаковые сцепления с генами DqA и Dr. Это аллели DqA 01 и Dr 01, 10. Однако это сцепление в русской популяции более выражено (Д=108 Н=12.7) чем в башкирской (Д=11, Н=1.3). Именно в этом, по видимому, причина относительно более высокой частоты встречаемости Dr 1 у русских по сравнению с башкирами. У башкир же появляется сцепление DqB 501 с Dr 15 и 16 на невысоких цифрах, что компенсирует потерю в частоте данных антигенов у башкир, потерянное в снижении сцепления с 602/8.

Последний из широко распространённых в популяциях аллель, а именно, DqB 602/8 имеет примерно одинаковые сцепления по антигенам HLA 2 класса у русских и башкир, проживающих в Челябинской области. Это основное сцепление с DR 13, которое тем не менее, несколько выше у башкир, но через но реализующееся через различные аллели DqA. Для башкир более хаpaктерен DqA 103, а для русских в равной степени 101,102,103. И отмечается второе по силе сцепление DqB 602/8 с Dr 15, которое несколько выше у русских. Кроме того, у русских ещё отмечается средней силы сцепление DqB 602/8 с Dr 17 (а потом В8 и А1), и также Dr 11 (В12,15,18).

Закдючение

• Основные генетические сцепления генов HLA 2 класса различны в основных этнических группах русских и башкир, проживающих в Челябинской области. Для башкир более хаpaктерны сцепления DqB 0201-Dr 07, DqB 301-Dr Dr 12, для русских DqB 0201-Dr 017, DqB 301-Dr Dr 11,
• Различные генетические сцепления определяют различие в частоте встречаемости антигенов HLA в этнических группах башкир и русских, проживающих в Челябинской области. В этнической группе русских, проживающих в Челябинской области достоверно чаще встречаются антигены А1, А3, В8, Dr 17, Dr 11, для башкир более хаpaктерны антигены А19(30), В13, 40, Dr 7, 12.

---