ЧАСТОТЫ ГАПЛОТИПОВ HLA DQB-DR (HF) НЕРАВНОВЕСНОЕ СЦЕПЛЕНИЕ (LD) В ОСНОВНЫХ ПОПУЛЯЦИЯХ ПРОЖИВАЮЩИХ В ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ > Полезные советы
Тысяча полезных мелочей    

ЧАСТОТЫ ГАПЛОТИПОВ HLA DQB-DR (HF) НЕРАВНОВЕСНОЕ СЦЕПЛЕНИЕ (LD) В ОСНОВНЫХ ПОПУЛЯЦИЯХ ПРОЖИВАЮЩИХ В ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ

ЧАСТОТЫ ГАПЛОТИПОВ HLA DQB-DR (HF) НЕРАВНОВЕСНОЕ СЦЕПЛЕНИЕ (LD) В ОСНОВНЫХ ПОПУЛЯЦИЯХ ПРОЖИВАЮЩИХ В ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ

Суслова Т.А. Статья в формате PDF 304 KB Челябинская область расположена на Южном Урале. Данная территория, находясь на границе Европы и Азии, являлась местом пересечения многих трaнcпортных путей с Севера, Юга, Казахстана, Средней Азии, Сибири. Южный Урал находится на пересечении нескольких континентальных областей, где население хаpaктеризуется различными языками, религиями и культурой. Территория заселялась в результате смешения различных популяций: русских, башкир и татар. Русская этническая группа, проживающая на данной территории, относится к кавказоидам, В этногенезе башкир в различной степени участвовали иранские, финно-угорские и тюркские племена на протяжении двух последних тысячелетий. Основная цель работы - установление генетического профиля популяций русских и башкир, основанной на типировании HLA-A, -B -DRB1, DQA1 и DQB1 локусов.

Выбор HLA, как генетической системы для исследования обусловлен ещё и тем, что известно достаточно много ассоциаций некоторых генов HLA с заболеваниями. Наиболее классический пример HLA-ассоциированных заболеваний - связь HLA-DR4 аллели с ревматоидным артритом и HLA-B27 со спондилитом. Исследования наиболее важных ассоциаций между HLA и аутоиммунными заболеваниями, а также инфекциями публиковались ранее.В настоящей работе была оценена частота аллелей и гаплотипов HLA в двух южноуральских популяциях и их связанность с другими европейскими и монголоидными популяциями. Установление иммуногенетических норм распределения генов HLA в основных популяциях, проживающих в Челябинской области может явиться основой для проведения исследований о влиянии антропогенных факторов окружающей среды на здоровье населения. Материалы и методы. Типирование HLA 1 класса было проведено серологически, HLA 2 класса методом PCA-SSP.110 здоровых неродственных русских и 78 башкир, проживающих в Челябинской области, были протипированы по HLA-A, -B, DRB1, -DQA1, -DQB1 генам. Все они были русскими и башкирами и их семьи проживали в Челябинской области по меньшей мере на протяжении трех поколений. Все они были донорами крови.

Статистический анализ.

Частоты антигенов HLA были расчитаны по формуле AF - сумма частот аллели/ число обследованных лиц. LD - неравновесное сцепление двух локусов HLA определено как разность между ожидаемой и наблюдаемой частотой гаплотипа HLA. Достоверность различий оценивалась критерием Х2.

Таблица 1. Частоты антигенов HLA в популяциях русских и башкир Челябинской области.

HLA

Русские

Башкиры

χ2

HLA

Русские

Башкиры

χ2

Ах, %

Ах, %

 

Ах, %

Ах, %

А1

21,2

11,5

4,3

DR16

10.9

12

0

А2

53,7

66,7

5,1

DR17

19.1

6

5,6

А3

23,8

12,8

5

DR4

14.5

16

0

А9

23,3

24,4

0

DR11

19.1

8

4,1

А10

21,5

21,8

0

DR12

5.5

24

9,1

А11

13,5

12,8

0

DR13

26.4

30

0

А19

2,5

9,0

11,7

DR14

2.7

4

0,1

А28

1,1

2,6

1,3

DR7

23.6

38

1,6

А30

*

5,1

*

DR8

6.4

8

0

 

 

 

 

DR9

5.5

10

0,6

В5

12,0

20,5

5

DR10

1.8

6

1,5

В7

23,5

20,5

0,4

DQA101

28,2

28

0,2

В8

13,0

6,4

2,9

DQA102

35,5

34

0,5

В12

16,2

9

2,9

DQA103

16,4

28

1,5

В13

12,4

32,1

25,4

DQA201

24,5

38

1,3

В14

6,4

2,6

1,9

DQA301

20,9

22

0,1

В15

13,0

9

1,1

DQA401

5,5

4

0,3

В16

10,5

9

0,2

DQA501

47,3

30

5,9

В17

7,5

7,7

0

DQA601

*

8

*

В18

11,8

9

0,6

DQB201

33,6

38

0

В21

3,8

6,4

1,3

DQB301

39,1

44

0

В22

2,3

2,6

0

DQB302

9,1

6

0,8

В27

12,5

12,8

0

DQB303

10,0

8

0,4

В35

20,1

10,3

4,6

DQB401/2

6,4

4

0,6

В40

13,2

23,1

6,3

DQB501

27,3

24

0,7

В41

6,6

2,6

2

DQB502/4

10,9

14

0,1

DR1

26.4

16

3,1

DQB601

3,6

4

0

DR15

26.4

16

3,1

DQB602/8

38,2

46

0,1


В таблице 1 представлены частоты антигенов HLA -A, -B, DRB1, DQA1 DQB1 в популяциях русских и башкир Челябинской области. Всего было определено 9 антигенов HLA-A, 16 HLA-B, 13 HLA-DRB1, 7 HLA-DQA и 9 HLA-DQB1.

Данные таблицы свидетельствуют о том, что наибольшие отличия по распределению антигенов HLA между двумя исследуемыми группами наблюдался в 1 классе (локусы А, где отмечены достоверные отличия по 4 антигенам, и В - также по 4 антигенам), и менее выражены в локусах 2 класса, Dr - 3 антигена, DqA - только 1 антиген. В локусе DqB вообще нет отличий в частоте встречаемости антигенов HLA между русской и башкирской этнических группах, проживающих на Южном Урале. Однако, величины Д неравновесного сцепления между генами HLA DqB и Dr имеют различные особенности у русского и башкирского населения, что приводит, по-видимому, и к различной частоте встречаемости этих антигенов в изучаемых популяциях.

Таблица 2. Неравновесное сцепление и частоты гаплотипов в популяциях русских и башкир, проживающих в Челябинской области.

Русские

Башкиры

Haplotype

LD

HF

Haplotype

LD

HF

DQB 201-Dr17

87.26

10.92

DQB 201-DR07

141.58

18.68

Dr 17 - В8

84,02

9,48

Dr 07 - В13

118.41

16.09

В8-А1

39.96

4,84

В13-А2

42,96

11,72

DqB 301 -Dr 11

83,08

10,56

DqB 301 - Dr 12

95,95

12,82

DqB 301 - Dr 04

20,0

3.0

DqB 301 - Dr 04

32,1

5,6

DqB 302 - Dr 4

35.4

3,9

DqB 302 - Dr 4

18.2

1.9

DqB 501 - Dr 1

108,6

12,7

DqB 501 - Dr 1

11,8

1,7

DqB 602/8 - Dr 13

102,2

13,6

DqB 602/8 - Dr 13

120

16,3

DqB 602/8 - Dr 15

81

11,0

DqB 602/8 - Dr 15

61

8,3

Итак, наименьшие различия в изученных популяциях отмечено по частоте встречаемости антигенов HLA DqB. Видимо этот локус является филогенетически наиболее древним и в момент формирования этого локуса исследуемые популяции составляли единую этническую общность или представляли из себя их общего предка. 4 основных антигена DqB встречаются с максимальной частотой и среди русских и среди башкир, проживающих на Южном Урале.. Это аллельные варианты DqB : 0201, 0301, 0501, 0602/8. Частота встречаемости каждого из них в обеих изучаемых популяциях составляет не менее 26%.

Наибольшее внимание привлекает аллель 0201. Он встречается у 38% башкир и 33,% русских. Однако неравновесное сцепление данного антигена с аллелями других локусов у данных популяций оказались различными. У русских DqB 0201 максимально сцеплен с DqA 501(78) и Dr 17 (87.26). Аллель Dr 17 в свою очередь имеет наибольшее сцепление с антигенами 1 класса В8 и А1, формируя, таким образом, устойчивый (древний) гаплотип А1-В8- DR-17-DqA 0501-DqB 0201. Лица, несущие в фенотипе этот гаплотип, отличаются сильными иммунологическими реакциями: выработка антител к чужеродным антигенам быстрая, их титр высокий и держится довольно долго. У них же очень часто повышены реакции гумopaльного и клеточного иммунитета на собственные антигены - что предрасполагает их носителей (в европейских популяциях) к развитию аутоиммунной патологии.

У башкир данный ген DqB 0201 имеет максимальное сцепление с DqA (Д=167) и DR 7 (Д=141), и с антигенами 1 класса В13-А2, формируя в популяции иной устойчивый «древний» гаплотип Dr 7-DQA 201- DQB 201. Возможно, лица, обладающие этим гаплотипом, имели селективное преимущество перед другими гаплотипами, этот признак закрепился в популяции в процессе естественного отбора. Он отмечен как доминирующий в некоторых других монголоидных популяциях: китайцы Хан, монголы, зороастрийцы Ирана, жители Тувы и некоторые другие популяции, проживающие на территории России - буряты, ханты-манси.

Именно различными генетическими сцеплениями локусов HLA DqB с Dr, а того, в свою очередь с В и А можно объяснить достоверное повышение частот встречаемости в популяции русских антигенов Dr 17, В8, и А1, по сравнению с башкирами, а у башкир достоверное повышение частот Dr 7, В13, А2.

Аллельный вариант DqB 301 также является наиболее распространённым в обеих изучаемых популяциях. Однако, в изучаемых нами популяциях Челябинской области отмечены различные гаметные ассоциации с этим антигеном. У русских этот аллельный вариант DqB 301 сцеплен с геном Dr 11 (Д=80,3 Н=10,6), у башкир вариант DqB 301 сцеплен с иной аллельной формой Dr 6, а именно Dr 12 (Д=95, Н=12,8), Такое генетическое сцепление и делает антигены локуса Dr наиболее распространёнными в популяциях. Dr 11 - среди русских, а Dr 12 среди башкир, проживающих в Челябинской области, именно по частоте встречаемости этих антигенов достоверно различаются две основные популяции, проживающие на Южном Урале. Генетические сцепления Dr с генами HLA 1 класса менее устойчивые в силу большего расстояния на хромосоме, и кроме того сам локус В более полиморфен, поэтому здесь труднее выявить какие-либо закономерности в генетиеских сцеплениях между локусами. Но однако, можно отметить всё же, что заметные сцепления (после А1-В8 Dr 17 у русских), и Dr 7-В13-А2) у башкир отмечается для пар антигенов Dr 12- В40 у башкир. Именно по этому антигену тоже есть разница в частоте встречаемости у русских и башкир.

Кроме того, в обеих популяциях с аллелем DqB 301 сцеплен вариант Dr 04, благодаря чему у этого антигена примерно равная частота встречаемости и у русских и у башкир. Что, возможно, должно приводить к равной частоте Dr 4-зависимых заболеваний в популяциях.

Если говорить о генетических сцеплениях антигена Dr 4 - то можно ещё отметить, что в популяции башкир ЮУ не отмечается закономерность, прослеживающаяся у других монголоидных популяции России: а именно - высокое сцепление с DqB 0302, приводящее к более выраженному частоте встречаемости Dr 4 в популяции. Это закономерность выявлена для чукчи, саами, амерингос и др изолятах, имеющие в своём этногенезе монголоидный компонент.

Третья наиболее распространённая аллель локуса DqB - DqB 501 имеет одинаковые сцепления с генами DqA и Dr. Это аллели DqA 01 и Dr 01, 10. Однако это сцепление в русской популяции более выражено (Д=108 Н=12.7) чем в башкирской (Д=11, Н=1.3). Именно в этом, по видимому, причина относительно более высокой частоты встречаемости Dr 1 у русских по сравнению с башкирами. У башкир же появляется сцепление DqB 501 с Dr 15 и 16 на невысоких цифрах, что компенсирует потерю в частоте данных антигенов у башкир, потерянное в снижении сцепления с 602/8.

Последний из широко распространённых в популяциях аллель, а именно, DqB 602/8 имеет примерно одинаковые сцепления по антигенам HLA 2 класса у русских и башкир, проживающих в Челябинской области. Это основное сцепление с DR 13, которое тем не менее, несколько выше у башкир, но через но реализующееся через различные аллели DqA. Для башкир более хаpaктерен DqA 103, а для русских в равной степени 101,102,103. И отмечается второе по силе сцепление DqB 602/8 с Dr 15, которое несколько выше у русских. Кроме того, у русских ещё отмечается средней силы сцепление DqB 602/8 с Dr 17 (а потом В8 и А1), и также Dr 11 (В12,15,18).

Закдючение

  • Основные генетические сцепления генов HLA 2 класса различны в основных этнических группах русских и башкир, проживающих в Челябинской области. Для башкир более хаpaктерны сцепления DqB 0201-Dr 07, DqB 301-Dr Dr 12, для русских DqB 0201-Dr 017, DqB 301-Dr Dr 11,
  • Различные генетические сцепления определяют различие в частоте встречаемости антигенов HLA в этнических группах башкир и русских, проживающих в Челябинской области. В этнической группе русских, проживающих в Челябинской области достоверно чаще встречаются антигены А1, А3, В8, Dr 17, Dr 11, для башкир более хаpaктерны антигены А19(30), В13, 40, Dr 7, 12.


ТРАНСЦЕНДЕНТАЛЬНЫЙ СУБЪЕКТ КАК ФАКТОР БЫТИЯ

ТРАНСЦЕНДЕНТАЛЬНЫЙ СУБЪЕКТ КАК ФАКТОР БЫТИЯ Статья в формате PDF 244 KB...

01 02 2023 16:44:41

ТРАНСФОРМАЦИЯ НАСЕЛЕНИЯ ОХОТНИЧЬЕ-ПРОМЫСЛОВЫХ МЛЕКОПИТАЮЩИХ ПРИ ОСВОЕНИИ ЧАЯНДИНСКОГО ЛИЦЕНЗИОННОГО УЧАСТКА (ЗАПАДНАЯ ЯКУТИЯ)

ТРАНСФОРМАЦИЯ НАСЕЛЕНИЯ ОХОТНИЧЬЕ-ПРОМЫСЛОВЫХ МЛЕКОПИТАЮЩИХ ПРИ ОСВОЕНИИ ЧАЯНДИНСКОГО ЛИЦЕНЗИОННОГО УЧАСТКА (ЗАПАДНАЯ ЯКУТИЯ) В сообщении представлены сведения о трaнcформации населения охотничье-промысловых млекопитающих при освоении Чаяндинского лицензионного участка (Западная Якутия). Материалы собраны в 2009–2011 гг. В результате проведенных учетных работ и опросных сведений на территории лицензионного участка выявлено обитание 10 видов охотничье-промысловых млекопитающих из 20 видов, обитающих на территории Западной Якутии. На настоящий момент существенных изменений численности охотничье-промысловых животных на лицензионном участке не происходит. В целом воздействие геологоразведочных работ на нефть и газ носят локальный хаpaктер. ...

25 01 2023 5:51:15

НООСФЕРНОЕ ОБРАЗОВАНИЕ – ОТ ПРОШЛОГО К БУДУЩЕМУ

НООСФЕРНОЕ ОБРАЗОВАНИЕ – ОТ ПРОШЛОГО К БУДУЩЕМУ Статья в формате PDF 119 KB...

22 01 2023 22:39:49

ЭНЕРГОСБЕРЕГАЮЩАЯ ТЕХНОЛОГИЯ ВЫРАЩИВАНИЯ СОРГО В УСЛОВИЯХ АСТРАХАНСКОЙ ОБЛАСТИ

ЭНЕРГОСБЕРЕГАЮЩАЯ ТЕХНОЛОГИЯ ВЫРАЩИВАНИЯ СОРГО В УСЛОВИЯХ АСТРАХАНСКОЙ ОБЛАСТИ В обзорной статье рассмотрены основные элементы энергосберегающей технологии возделывания сорго в условиях Астpaxaнской области, к которым относятся: подготовка семян к посеву, севооборот, подбор сортов, нормы высева и способы посева, минеральные подкормки, борьба с сорными растениями и болезнями с помощью внесение гербицидов, орошение по фазам роста и развития, с помощью дождевания наименее энергозатратных агрегатов. ...

20 01 2023 20:12:54

МОНИТОРИНГ СОСТОЯНИЯ ВОДЫ РЕК ЕНИСЕЯ И КАЧИ

МОНИТОРИНГ СОСТОЯНИЯ ВОДЫ РЕК ЕНИСЕЯ И КАЧИ Статья в формате PDF 206 KB...

18 01 2023 18:57:55

БИОВОЛНОГЕНЕЗ: Ч.1. СТИХИЙНЫЕ БЕДСТВИЯ

БИОВОЛНОГЕНЕЗ: Ч.1. СТИХИЙНЫЕ БЕДСТВИЯ Статья в формате PDF 133 KB...

16 01 2023 4:38:10

ИССЛЕДОВАНИЕ МЕЖМОЛЕКУЛЯРНЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ В ПРОТЕИН-ПОЛИСАХАРИДНЫХ ГЕЛЯХ МЕТОДОМ Н+ЯМР-РЕЛАКСАЦИИ

ИССЛЕДОВАНИЕ МЕЖМОЛЕКУЛЯРНЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ В ПРОТЕИН-ПОЛИСАХАРИДНЫХ ГЕЛЯХ МЕТОДОМ Н+ЯМР-РЕЛАКСАЦИИ Методом Н+ЯМР-релаксации изучены межмолекулярные взаимодействия в гелях крахмала в молочной среде. Установлены зависимости скоростей поперечной и продольной релаксаций протонов от концентрации крахмала для водных и молочных систем. Казеин синергетически влияет на гелеобразующую способность крахмала, который иммобилизует воду в молочной среде более активно, чем в водной. На основании исследований температурной зависимости поперечной релаксации доказано образование комплексного геля, представляющего собой сетку из спиральных молекул крахмала, в ячейки которой включены мицеллы и субмицеллы казеина. ...

11 01 2023 2:17:38

ПИЩЕВАЯ СПЕЦИАЛИЗАЦИЯ ДАУРСКОЙ ПИЩУХИ (OCHOTONA DAURICA)

ПИЩЕВАЯ СПЕЦИАЛИЗАЦИЯ ДАУРСКОЙ ПИЩУХИ (OCHOTONA DAURICA) Статья в формате PDF 140 KB...

10 01 2023 13:26:58

АЛЬТЕРНАТИВНЫЕ ВИДЫ ЭНЕРГИИ

АЛЬТЕРНАТИВНЫЕ ВИДЫ ЭНЕРГИИ Статья в формате PDF 100 KB...

31 12 2022 1:43:44

ЛАЗЕРОТЕРАПИЯ БРОНХИАЛЬНОЙ АСТМЫ

ЛАЗЕРОТЕРАПИЯ БРОНХИАЛЬНОЙ АСТМЫ Статья в формате PDF 169 KB...

30 12 2022 20:28:21

ТРАНСФОРМАЦИЯ ВЗАИМНОЙ ТОРГОВЛИ В СИСТЕМЕ СТРАН БРИКС + ИРАН

ТРАНСФОРМАЦИЯ ВЗАИМНОЙ ТОРГОВЛИ В СИСТЕМЕ СТРАН БРИКС + ИРАН С использованием инструмента «Bilateral Trade» базы данных Trade Map проделаны матричный анализ взаимной торговли в системе стран БРИКС + Иран за 2001 и 2010 гг. Расчеты показали на существенную трaнcформацию взаимной торговли в системе рассматриваемых стран, в которой Россия значительно ухудшила свои позиции, а Бразилия и Китай – улучшили. Показано также, что Иран гораздо лучше интегрирован во взаимную торговлю со странами БРИКС по сравнению с ЮАР, что даёт ему весомый аргумент для вступления в это объединение стран. ...

26 12 2022 23:26:53

УРОВНИ ВЕЖЛИВОГО ОБЩЕНИЯ

УРОВНИ ВЕЖЛИВОГО ОБЩЕНИЯ Статья в формате PDF 324 KB...

21 12 2022 0:27:35

АНАЛИЗ ФАРМАКОТОКСИЛОГИЧЕСКОГО ДЕЙСТВИЯ ЭТАЦИЗИНА И ДИМЕФОСФОНА ПРИ ХРОНИЧЕСКОМ СТРЕССЕ

АНАЛИЗ ФАРМАКОТОКСИЛОГИЧЕСКОГО ДЕЙСТВИЯ ЭТАЦИЗИНА И ДИМЕФОСФОНА ПРИ ХРОНИЧЕСКОМ СТРЕССЕ В работе исследовали влияние этацизина и димефосфона на cмepтность белых мышей и динамику поведенческих реакций в условиях хронического гиподинамического стресса. Показано токсическое влияние этацизина: увеличение cмepтности животных и негативное влияние на поведенческие реакции. Димефосфон не оказывал влияния на летальность и проявлял стресспротекторное ...

20 12 2022 6:28:15

Еще:
Поддержать себя -1 :: Поддержать себя -2 :: Поддержать себя -3 :: Поддержать себя -4 :: Поддержать себя -5 :: Поддержать себя -6 :: Поддержать себя -7 :: Поддержать себя -8 :: Поддержать себя -9 :: Поддержать себя -10 :: Поддержать себя -11 :: Поддержать себя -12 :: Поддержать себя -13 :: Поддержать себя -14 :: Поддержать себя -15 :: Поддержать себя -16 :: Поддержать себя -17 :: Поддержать себя -18 :: Поддержать себя -19 :: Поддержать себя -20 :: Поддержать себя -21 :: Поддержать себя -22 :: Поддержать себя -23 :: Поддержать себя -24 :: Поддержать себя -25 :: Поддержать себя -26 :: Поддержать себя -27 :: Поддержать себя -28 :: Поддержать себя -29 :: Поддержать себя -30 :: Поддержать себя -31 :: Поддержать себя -32 :: Поддержать себя -33 :: Поддержать себя -34 :: Поддержать себя -35 :: Поддержать себя -36 :: Поддержать себя -37 :: Поддержать себя -38 ::